Kapa Biosystems Next-Generation Sequencing

KAPA Biosystems
Next-Generation Sequencing

  • Kitsysteme zur Herstellung von NGS-Bibliotheken in unter 3 Stunden
  • Protein-Engineering optimierte Proofreading-Polymerase
  • Amplifikation mittels Endpunkt- oder Real-Time PCR
  • Quantifizierung amplifizierbarer DNA
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NGS Workflow

Roche Sequencing Solutions KAPA

KAPA Library Preparation

Die KAPA Library Preparation ist ein wesentlicher Bestandteil des Roche Sequencing Solutions Workflows. 

 Sample  MagNa Pure NA Aufreinigung  KAPA Library Preparation  Target Enrichment  Automation  Analyse und Report
                    Sample MagNa Pure NA-Aufreinigung KAPA Library Preparation Target Enrichment Sequenzierung und Automation     Analyse und Report 

Übersicht

Kit Selection by Application

KAPA Kit Selection Table

Die Tabelle bietet einen Überblick über das Sample Preparation Portfolio.

  • Detaillierte Informationen zu spezifischen Produkten finden Sie in unserem Produktkatalog.
  • Eine Übersicht der KAPA-Kits und Reagenzien inklusive Materialnummer finden Sie in unserem Portfolio.
  • Bei Fragen zu Ihrer Sequenzierung wenden Sie sich gerne an unseren fachlichen Support unter: 0621 759 79119 oder

Automatisierungslösungen

Automatisierlösungen NGS

Die Produkte sind kompatibel zu verschiedenen Automationslösungen. Unsere KAPA Library Preparation und Target Enrichment Produkte lassen sich entsprechend der Kundenbedürfnisse automatisieren.

Vorteile:

  • Hoher Durchsatz realisierbar
  • Automation mit kürzerer Hands-On-Zeit

KAPA Workflow

Next-Generation Sequencing

Durch die Fortschritte im Next-Generation Sequencing (NGS) und das stetig zunehmende Probenaufkommen werden effiziente und kosteneffektive Protokolle zur Herstellung, Amplifikation und Quantifizierung von Bibliotheken für die Multiplex-Sequenzierung dringend benötigt. Das beeindruckende NGS-Portfolio von Kapa Biosystems beinhaltet Enzyme wie zum Beispiel neuartige DNA-Polymerasen, die die Leistungsfähigkeit des gesamten Sequenzierungs-Workflows verbessern können.

 

KAPA Workflow

Das KAPA Portfolio bietet alle Produkte für den Library Preparation Workflow

Portfolio

Portfolio


KAPA


KAPA Sample QC Solutions

Proben-Qualitätskontrolle

Eine der größten Herausforderungen bei der Hochdurchsatz-Sequenzierung ist es, die Erfolgsrate bei der Verarbeitung von Proben mit niedriger DNA-Konzentrationen und variabler Qualität in Standard-Probenvorbereitungspipelines, konstant zu halten.

Das KAPA hgDNA Quantification and QC Kit eignet sich für die verlässliche Quantifizierung und Qualitätsprüfung von humaner genomischer DNA vor der Herstellung der NGS-Bibliothek. Die Kits enthalten KAPA SYBR FAST qPCR Master Mix, DNA Standards und Primer für hochkonservierte humane Loci. Die Ergebnisse geben Aufschluss über den zu erwartenden Erfolg bei der Herstellung der Bibliothek, die Ausbeute nach der Amplifikation sowie die durchschnittliche Insert-Länge. 

Weitere Informationen

KAPA hgDNA Quantification and QC Kits


Kapa


KAPA DNA Library Preparation Solutions 

DNA-Sequenzierung

KAPA Library Preparation Kits enthalten alle benötigten Enzyme und Reaktionspuffer für die Herstellung von NGS-Bibliotheken aus fragmentierter dsDNA. Die Kits ermöglichen eine hocheffiziente Umwandlung von Input-DNA in sequenzierbare Moleküle. Der Workflow umfasst folgende Schritte: End Repair, A-Tailing, Adaptor Ligation und Library Amplification.

KAPA Library Preparation Kits

Die KAPA Library Preparation Kits überzeugen durch hohe Komplexität der hergestellten Bibliotheken, eine geringere Duplikationsrate, optimale Sequenzabdeckung und hohe Datenqualität. Die KAPA Library Preparation Kits bieten Flexibilität in Bezug auf Probenmaterial, DNA Konzentration und Fragment-Länge. Eine Auswahl an Adapter-Designs und Amplifikations-Methoden ermöglichen die Anwendung verschiedener Sequenziertechniken.

KAPA HyperPrep Kits

Die KAPA HyperPrep Kits bieten eine herrausragende Geschwindigkeit und Performance. Sie liefern einen optimierten Workflow und vielseitige Library Preparation Solutions, welche die Library Präparationszeit deutlich reduzieren. Unsere "single-tube" Chemie bietet Verbesserungen in der Library-Konstruktionseffizienz, besonders für herausfordernde Proben wie zum Beispiel FFPE und cell-free DNA.

Vorteile:

  • Herrausragende Geschwindigkeit und Performance
  • Geringe Duplikationsraten und höhere Sequenzierabdeckung
  • Verbesserte Preformance bei low-input-Proben
  • High-Quality Library-Konstruktion von FFPE Proben
  • PCR-freie Workflows
  • Diverse Automationsmöglichkeiten

Weitere Informationen

KAPA HyperPlus Kits

Die KAPA HyperPlus Kits liefern einen optimierten Workflow, in dem DNA-Fragmentierung und Library-Konstruktion in einem einzelnen Röhrchen durchgeführt werden. Diese integrierte Lösung zur effizienten und hoch qualitativen Library-Erstellung kombiniert die KAPA HyperPrep Kits mit der Geschwindigkeit und dem Komfort von Tagmentation-basierten Workflows.

Vorteile:

  • DNA-Fragmentierung und Library Preparation in 2,5 Stunden
  • Sehr flexibeler DNA-Input (1 ng - 1 µg)
  • Reduzierten Bias und einheitlichere Sequenzabdeckung
  • PCR-freier Workflow von geringeren Inputs
  • Hervorragende Conversion Rate (Effizienz der Library Preparation), besonders für FFPE DNA
  • Flexibel im Hinblick auf Fragmentgröße, Adapterdesign und Library Amplifikation
  • Diverse Automationsmöglichkeiten
  • Komplette Library Preparation Lösung mit KAPA Adaptern und KAPA Pure Beads

Weitere Informationen

KAPA HyperPrep Kits

KAPA HyperPlus Kits


Kapa


KAPA RNA Library Preparation Solutions

RNA-Sequenzierung

RNA Sequenzierung spielt bei der Untersuchung der Genexpression und bei Transkriptom-Analysen eine große Rolle. RNA-Analyse durch Next-Generation Sequenzierung (RNA-seq) ermöglicht signifikant höhere Auflösung des Transkriptionsprofils im Vergleich zu anderen Methoden wie Sanger-Sequenzierung und Microarrays. RNA-Seq Anwendungen beinhalten:

  • Genexpressionsanalyse
  • Identifikation neuer Transkripte
  • Detektion von Fusionsgenen, Isoformen und anderen Strukturvatianten
  • SNV-Entdeckungen
  • Ganze Transkription

Abhängig von der Anreicherungs-oder Depletionsstrategie, kann RNA-Seq nützlich sein, um verschiedene RNA-Populationen, wie Gesamt-RNA, non-coding RNA (z.B. microRNA, IncRNA, usw.) und mRNA evaluieren zu können. Im Weiteren finden Sie eine Übersicht von verfügbaren KAPA RNA Library Prep Produkten, bezüglich der RNA-Anreicherungsstrategie zusammengefasst:

rRNA Depletion mit KAPA RiboERrase (HMR)

KAPA RiboErase (HMR) Kits mit rRNA-Depletion beinhalten alle Enzyme und Puffer für ribosomale RNA-Depletion und Library Preparation für Illumina-Sequenzierplattformen. Die Kits bieten einheitlichere und effektivere rRNA-Depletion als traditionelle, Bead-basierte Capture-Methoden mit erhöhter Abdeckungen der gewünschten Transkripte 

mRNA Capture

KAPA mRNA Capture Kits beinhalten alle Enzyme und Puffer, die für die Isolation von Poly(A)-tailed RNA und cDNA Library Präparation für Illumina Sequenzierplattformen benötigt werden. Die Kits entfernen rRNA, pre-mRNA und nicht-kodierende RNA-Spezien für gezieltes Sequenzieren des angereicherten mRNA-Transkriptoms.

KAPA mRNA Hyper Prep Kits: Die optimierte Lösung für mRNA-Seq Library Präparation

KAPA Stranded mRNA-Seq Kits: Der traditionelle Workflow für mRNA-Seq Library Präparation

Keine RNA-Anreicherung

cDNA Library Präparation Kits ohne direkte RNA-Anreicherung beinhalten alle Enzyme und Puffer, die für cDNA Library Präparation für Illumina Next-Generation Sequencing benötigt werden. Die Kits ermöglichen präzises Bestimmen von Strangorientierungen, können die Abdeckung von GC-reichen und wenigen Transkripts verbessern und hohe Zuverlässigkeit bei wechselnden Transkripten gewährleisten.

KAPA Stranded mRNA-Seq Kits: Die optimierte Lösung für RNA-Seq Library Präparation

KAPA Stranded RNA-Seq Kits: Der traditioneller Workflow für mRNA-Seq Library Präparation


Weitere Informationen

Flyer:

KAPA RNA HyperPrep Kits

KAPA Stranded mRNA Kits

KAPA Stranded RNA Kits with RiboErase

KAPA

Adapter und Beads

Adapter und Aufreinigungsbeads

Adapter und Aufreinigungsbeads werden in allen KAPA DNA und RNA Library Preparation Protokollen benötigt. Hier finden Sie Adapter und Beads, um Ihre Library Preparation Workflow Lösung zu vervollständigen.

KAPA NGS Adapter Kits

KAPA Pure Beads


Kapa


KAPA Library Amplification Solutions

Library-Amplifikation

KAPA Library Amplification Kits enthalten die KAPA HiFi DNA Polymerase. Hierbei handelt es sich um eine Proofreading-Polymerase, die hohe Prozessivität und Replikationsgenauigkeit miteinander vereint. Erhöhte DNA-Affinität, erzielt durch eine gentechnisch veränderte Bindedomäne, sorgt für eine signifikant gesteigerte Performance im Vergleich zum Wildtyp. Ertrag, Sensitivität, Replikationsgeschwindigkeit, Target-Länge und die Sequenzabdeckung AT- und GC-reicher Abschnitte konnten dadurch verbessert werden.

KAPA HiFi ist in drei Varianten verfügbar: 

  • KAPA HiFi Library Amp ReadyMix für die Amlifikation von NGS-Bibliotheken über Endpunkt-PCR
  • KAPA HiFi Library Amp Real-Time inklusive SYBR Green I und vier Fluoreszenz-Konzentrationsstandards für die präzise Kontrolle während der Herstellung der Bibliothek
  • KAPA HiFi Uracil+ ReadyMix, eine Uracil-tolerante Variante für die effiziente und genaue Amplifikation von NGS-Bibliotheken nach Bisulfit-vermittelter Konvertierung von Cytosin zu Uracil in methylierter DNA beim 'Epigenetic Sequencing'.

Weitere Informationen

KAPA Library Amplification Kits


Kapa


KAPA Library Quantification Solutions        

Library-Quantifizierung

KAPA Library Quant ist ein System zur präzisen, qPCR-basierten Quantifizierung von NGS-Bibliotheken. Bei herkömmlichen elektrophoretischen und spektroskopischen Methoden wird die gesamte Nukleinsäurekonzentration bestimmt. Im Gegensatz dazu werden mit den KAPA Library Quant Kits nur Nukleinsäuren mit ligierten Adaptern quantifiziert, die durch Emulsions- oder Bridge-PCR amplifizierbar und damit für NGS relevant sind. Der für NGS optimierte KAPA SYBR FAST qPCR Master Mix enthält SYBR Green I sowie die KAPA SYBR FAST DNA Polymerase und erlaubt dadurch auch die effiziente Quantifizierungen von AT- und GC reicher DNA. Die im Kit enthaltenen Primer, DNA-Standards und Real-Time PCR-Reagenzien sind sowohl für die NGS-Plattformen als auch für die Real-Time Cycler spezifisch.

Weitere Informationen

KAPA Library Quantification Kits

Weitere Informationen zu Roche Sequencing Solutions

Kapa Biosystems: https://www.kapabiosystems.com/

Roche Sequencing Solutions: http://sequencing.roche.com/

Produkte

KAPA Katalog 2017:

 KAPA Katalog

KAPA NGS Portfolio:

KAPA NGS Portfolio


KAPA Hifi - Gerichtete Evolution

KAPA Enzyme Technology

Erfahren Sie mehr zur KAPA Enzyme Technology

Die KAPA HiFi DNA Polymerase ist eine Proofreading-Polymerase, die hohe Prozessivität und Replikationsgenauigkeit miteinander vereint. Die erhöhte DNA-Affinität, erzielt durch eine gentechnisch veränderte Bindedomäne, sorgt für eine signifikant gesteigerte Performance im Vergleich zum Wildtyp. Ertrag, Sensitivität, Replikationsgeschwindigkeit, Target-Länge und die Sequenzabdeckung AT- und GC-reicher Abschnitte konnten dadurch verbessert werden. 

Bestellung & Support

Bestellung & Support

Für Bestellungen der KAPA NGS Produkte, wenden Sie sich bitte an unsere Auftragsannahme unter: 0800 759 4152 oder

Den fachlichen Support für das NGS Portfolio von Kapa Biosystems erreichen Sie unter: 0621 759 79119 oder

Für sämtliche weiteren Informationen wenden Sie sich bitte an Ihren lokalen Ansprechpartner von Roche Diagnostics Deutschland oder verwenden Sie das Kontaktformular auf dieser Seite.

Empfohlene Publikationen

Empfohlene Publikationen

Optimale enzymes for amplifying sequencing libraries

Wissenschaftler am Sanger Center untersuchten viele thermostabile DNA Polymerasen unter mehreren verschiedenen Reaktionsbedingungen für Illumina Sequenzierung um ihren Bias zu bestimmen. MEHR LESEN


Quantitation of next generation sequencing library preparation protocol efficiencies

Diese Publikation liefert einen quantitativen Vergleich von verschiedenen kommerziell verfügbaren Library Kits im Hinblick darauf, den Bias zu minimieren und die Ausbeute und die Zeiteffizienz zu optimieren. Jedes Library Preparation Kit wurde getestet, indem dieselbe DNA-Probe als Startmaterial genommen wurde und die DNA-Menge nach jedem Protokollschritt bestimmt wurde. Die Ergebnisse zeigen, dass verschiedene Schritte von KAPA HyperPlus und KAPA HyperPrep Kits kombiniert einen Ertrag erzielen, der 4-7 mal höher ist als in anderen Kits. MEHR LESEN


Optimizing illumina next-generation sequencing library peparation for extremely AT-biased genomes

Entwicklung einer robusten und optimierten Next-Generation Sequencing Library Amplification Methode, geeignet für extrem AT-reiche Genome. MEHR LESEN


Library preparation methods for next-generation sequencing: Tone down the bias

Optimierung von Library Preparation Methoden zur Reduktion von Bias mit der Verwendung von KAPA Hifi Polymerase. MEHR LESEN