Analysemethode

PCR

Probentyp

Typische klinische Proben sind nasopharyngeale Abstriche, Trachealaspirate oder bronchoalveoläre Lavage.

Nachweis

Ein 152 bp langes Fragment des Polyprotein-Gens wird mit spezifischen Primern amplifiziert und mit einer LC640-markierten Hydrolyse-Sonde (640-Kanal) nachgewiesen.

Wellenlänge

PCR Nachweis bei Wellenlänge 640 nm¹.

Systeme

LightCycler® 480 II Instrument

Mit diesem Assay werden 10 Genom-Äquivalentkopien oder weniger pro Reaktion nachgewiesen.

Coronaviren (CoV) sind positiv-strängige RNA-Viren, die zur Familie der Coronaviridae gehören. Es gibt sechs verschiedene Coronaviren, die den Menschen infizieren und Krankheiten verursachen können. Die humanen Coronavirus-Stämme 229E und NL63 aus der Alpha-Gruppe, sowie OC43 und HKU1 aus der Beta-Gruppe verursachen in der Regel leichte bis mittelschwere Erkrankungen, wie eine Erkältung. Die SARS-CoV-Pandemie von 2003 mit 792 Todesopfern und das aus Arabien stammende MERS-CoV mit inzwischen mehr als 850 Todesfällen haben diese Virusfamilie weltweit bekannt gemacht.

2019 wurde das Lungenentzündungsvirus SARS-CoV-2 erstmals Ende Dezember 2019 gemeldet, nachdem Dutzende Besucher eines Fischmarktes an einer schweren Lungenentzündung erkrankt waren, die nun COVID-19 genannt wird. Anfang Februar 2020 gab es 27.000 bestätigte Infektionen und 560 Todesfälle; die Sterblichkeitsrate ist im Vergleich zu SARS geringer, während die Inkubationszeit viel länger zu sein scheint.

Das am 11. Januar veröffentlichte Genom (Genbank acc. MN908947) weist eine große Ähnlichkeit mit dem SARS-Virus auf.

Coronaviren befallen vor allem die unteren Atemwege (Lungenentzündung), aber SARS-CoV-2 findet sich auch in der Nase, im Rachen, im Darm (Stuhlproben) und wahrscheinlich im Urin.